MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stackebrandtia nassauensis DSM 44728 chromosome

Total Repeats: 180995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013947	TGA	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013947	CGA	2	6	81	86	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297539
3	NC_013947	ATC	2	6	157	162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297539
4	NC_013947	CCGCA	2	10	164	173	20 %	0 %	20 %	60 %	291297539
5	NC_013947	CG	4	8	180	187	0 %	0 %	50 %	50 %	291297539
6	NC_013947	CGG	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297539
7	NC_013947	CG	3	6	247	252	0 %	0 %	50 %	50 %	291297539
8	NC_013947	GCC	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
9	NC_013947	CGC	2	6	290	295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
10	NC_013947	GACCG	2	10	348	357	20 %	0 %	40 %	40 %	291297539
11	NC_013947	CCCA	2	8	400	407	25 %	0 %	0 %	75 %	291297539
12	NC_013947	CGC	2	6	479	484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
13	NC_013947	CCCG	2	8	516	523	0 %	0 %	25 %	75 %	291297539
14	NC_013947	CCG	2	6	550	555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
15	NC_013947	CGC	3	9	647	655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
16	NC_013947	GCC	2	6	711	716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
17	NC_013947	CCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297539
18	NC_013947	CGC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
19	NC_013947	CGCC	2	8	824	831	0 %	0 %	25 %	75 %	291297539
20	NC_013947	CTG	2	6	886	891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297539
21	NC_013947	GAG	2	6	955	960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297539
22	NC_013947	TCA	2	6	974	979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297539
23	NC_013947	CGA	2	6	990	995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297539
24	NC_013947	CGT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297539
25	NC_013947	CGA	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297539
26	NC_013947	AGG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297539
27	NC_013947	TTC	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291297539
28	NC_013947	AGC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297539
29	NC_013947	GGA	2	6	1179	1184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297539
30	NC_013947	GCC	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
31	NC_013947	AGA	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291297539
32	NC_013947	GGC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297539
33	NC_013947	CGC	2	6	1295	1300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
34	NC_013947	GC	3	6	1358	1363	0 %	0 %	50 %	50 %	291297539
35	NC_013947	CAA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291297539
36	NC_013947	CCTGGC	2	12	1410	1421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291297539
37	NC_013947	CAC	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297539
38	NC_013947	CAT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297539
39	NC_013947	CCG	2	6	1496	1501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297539
40	NC_013947	ACT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297539
41	NC_013947	CGCC	2	8	1563	1570	0 %	0 %	25 %	75 %	291297539
42	NC_013947	CGG	2	6	1635	1640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297539
43	NC_013947	ACCAC	2	10	1646	1655	40 %	0 %	0 %	60 %	291297539
44	NC_013947	CCG	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013947	CTC	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013947	TCG	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013947	GCT	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013947	TG	3	6	2117	2122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013947	TGG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013947	GGT	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013947	CCG	2	6	2187	2192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013947	GGC	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013947	GCA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013947	TGG	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013947	CCGT	2	8	2318	2325	0 %	25 %	25 %	50 %	291297540
56	NC_013947	TGA	2	6	2346	2351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291297540
57	NC_013947	CCAG	2	8	2400	2407	25 %	0 %	25 %	50 %	291297540
58	NC_013947	GCT	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297540
59	NC_013947	CGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
60	NC_013947	GGA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297540
61	NC_013947	CGC	3	9	2629	2637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
62	NC_013947	GCC	2	6	2645	2650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
63	NC_013947	CCG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
64	NC_013947	GCC	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
65	NC_013947	GAC	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297540
66	NC_013947	GCT	2	6	2740	2745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297540
67	NC_013947	ACCG	2	8	2750	2757	25 %	0 %	25 %	50 %	291297540
68	NC_013947	GCG	2	6	2874	2879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297540
69	NC_013947	CGC	2	6	2935	2940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
70	NC_013947	CAC	2	6	2953	2958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297540
71	NC_013947	GCC	2	6	2983	2988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
72	NC_013947	CGC	2	6	3016	3021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
73	NC_013947	CGC	2	6	3037	3042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
74	NC_013947	CG	3	6	3058	3063	0 %	0 %	50 %	50 %	291297540
75	NC_013947	CGC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297540
76	NC_013947	CGACGG	2	12	3112	3123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291297540
77	NC_013947	TGG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297540
78	NC_013947	GAC	3	9	3326	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297540
79	NC_013947	TCG	2	6	3433	3438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297541
80	NC_013947	GGC	2	6	3453	3458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297541
81	NC_013947	CGCGC	2	10	3566	3575	0 %	0 %	40 %	60 %	291297541
82	NC_013947	CCGG	2	8	3594	3601	0 %	0 %	50 %	50 %	291297541
83	NC_013947	CGT	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297541
84	NC_013947	CGG	2	6	3668	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297541
85	NC_013947	CGA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297541
86	NC_013947	CGG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297541
87	NC_013947	CGG	2	6	3797	3802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297541
88	NC_013947	GCC	2	6	3851	3856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297541
89	NC_013947	CGGG	2	8	3880	3887	0 %	0 %	75 %	25 %	291297541
90	NC_013947	CTG	2	6	3969	3974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297541
91	NC_013947	CGG	2	6	4003	4008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297541
92	NC_013947	GTG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297541
93	NC_013947	GCT	2	6	4049	4054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297541
94	NC_013947	GAG	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297541
95	NC_013947	CG	3	6	4199	4204	0 %	0 %	50 %	50 %	291297541
96	NC_013947	GAC	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297541
97	NC_013947	CGC	2	6	4247	4252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297541
98	NC_013947	GA	3	6	4320	4325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013947	G	6	6	4341	4346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013947	CGG	2	6	4374	4379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
101	NC_013947	ACGTCG	2	12	4411	4422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291297542
102	NC_013947	TCG	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
103	NC_013947	CGC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297542
104	NC_013947	GC	3	6	4547	4552	0 %	0 %	50 %	50 %	291297542
105	NC_013947	CCGC	2	8	4570	4577	0 %	0 %	25 %	75 %	291297542
106	NC_013947	GCT	2	6	4604	4609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
107	NC_013947	GCG	2	6	4757	4762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
108	NC_013947	GC	3	6	4814	4819	0 %	0 %	50 %	50 %	291297542
109	NC_013947	GTC	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
110	NC_013947	AGC	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297542
111	NC_013947	CTG	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
112	NC_013947	CGG	2	6	4886	4891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
113	NC_013947	CTG	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
114	NC_013947	GGC	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
115	NC_013947	GGC	2	6	5041	5046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
116	NC_013947	GAAC	2	8	5078	5085	50 %	0 %	25 %	25 %	291297542
117	NC_013947	CTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
118	NC_013947	CCGC	2	8	5140	5147	0 %	0 %	25 %	75 %	291297542
119	NC_013947	CAC	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297542
120	NC_013947	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297542
121	NC_013947	CGA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297542
122	NC_013947	GCCA	2	8	5238	5245	25 %	0 %	25 %	50 %	291297542
123	NC_013947	GCG	2	6	5286	5291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
124	NC_013947	CTG	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
125	NC_013947	CGA	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297542
126	NC_013947	GCG	2	6	5363	5368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
127	NC_013947	TCG	2	6	5386	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297542
128	NC_013947	GCG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297542
129	NC_013947	ACG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297542
130	NC_013947	TCA	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297543
131	NC_013947	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297543
132	NC_013947	TCG	2	6	5663	5668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297543
133	NC_013947	ATC	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297543
134	NC_013947	CGG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297543
135	NC_013947	GGT	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297543
136	NC_013947	CGG	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297543
137	NC_013947	CGG	2	6	5917	5922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013947	G	6	6	5973	5978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013947	CGGG	2	8	6071	6078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013947	GAC	3	9	6111	6119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013947	AAC	2	6	6146	6151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013947	TGG	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297544
143	NC_013947	GCG	2	6	6170	6175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297544
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160	NC_013947	GGT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297544
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164	NC_013947	GAG	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297544
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170	NC_013947	ACCG	2	8	7121	7128	25 %	0 %	25 %	50 %	291297544
171	NC_013947	CGA	2	6	7138	7143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297544
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197	NC_013947	ACG	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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212	NC_013947	ACA	2	6	8876	8881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291297545
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220	NC_013947	TGG	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297545
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225	NC_013947	TGA	2	6	9521	9526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291297545
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231	NC_013947	AGCGGC	2	12	9677	9688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291297545
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241	NC_013947	TTC	2	6	9964	9969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291297545
242	NC_013947	CAA	2	6	9972	9977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291297545
243	NC_013947	CG	4	8	10029	10036	0 %	0 %	50 %	50 %	291297545
244	NC_013947	CTG	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297545
245	NC_013947	ACG	2	6	10109	10114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297545
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248	NC_013947	CGC	2	6	10184	10189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297545
249	NC_013947	CGG	2	6	10194	10199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297545
250	NC_013947	GCGACG	2	12	10220	10231	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291297545
251	NC_013947	GGT	2	6	10233	10238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297545
252	NC_013947	GCG	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297545
253	NC_013947	TCA	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291297545
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257	NC_013947	CGA	2	6	10317	10322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297545
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259	NC_013947	TCG	2	6	10373	10378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297545
260	NC_013947	CGA	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297545
261	NC_013947	GTC	2	6	10405	10410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297545
262	NC_013947	GCG	2	6	10442	10447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297545
263	NC_013947	GGC	2	6	10495	10500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297545
264	NC_013947	GCG	2	6	10530	10535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291297545
265	NC_013947	TCG	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291297545
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498	NC_013947	GAC	2	6	19217	19222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297552
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500	NC_013947	GAT	2	6	19409	19414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291297552

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